O Programa da Consulta Popular tem como objetivo fortalecer a agricultura familiar e as agroindústrias através de projetos elaborados pelos municípios e aprovados pela Secretaria, auxiliando os produtores rurais na busca constante do aumento da produtividade e da comercialização de seus produtos.  Ao todo, são mais de 130 projetos em andamento e os valores investidos ultrapassam os R$14,3 milhões.